食用鲜木耳可中毒，新鲜木耳中含有一种化学名称为“卟啉”的特殊物质，因为这种物质的存在，人吃了新鲜木耳后，经阳光照射会发生植物日光性皮炎，引起皮肤瘙痒，使皮肤暴露部分出现红肿、痒痛，产生皮疹、水泡，水肿。相比起来，干木耳更安全。
很多人为了图省事，简单地用水冲冲就吃。其实,木耳需要在水中浸泡一段时间，然后用自来水多冲洗几次，流动的水可避免农药渗入。
不要使用普通的洗涤剂清木耳，洗涤剂本身含有的化学成分容易残留在木耳上，对人体健康不利。最好的办法是使用盐水冲洗。但是，绝对不要在水中浸泡过长时间，否则木耳内的维生素会悉数流失，使营养价值降低，而且溶解于水的农药有可能会反渗入木耳中。